Відповідно до пункту 64.7. статті 64 ПК України після включення платника податків до Реєстру ВПП та отримання повідомлення центрального органу виконавчої влади, що забезпечує формування та реалізує державну податкову і митну політику, про таке включення платник податків зобов'язаний стати на облік у контролюючому органі, що здійснює супроводження ВПП, з початку податкового періоду (календарного року) на який сформовано Реєстр.

Щодо ВПП, які самостійно не стали на облік у контролюючому органі, що здійснює супроводження ВПП, центральний орган виконавчої влади, що забезпечує формування та реалізує державну податкову і митну політику, приймає рішення про зміну основного місця обліку та переведення їх на облік у контролюючі органи, що здійснюють супроводження ВПП.