У разі правового спору між контролюючим органом та платником, саме контролюючий орган має доводити пов'язаність осіб. Це випливає з положень пункту 56.4 ПК України та частини 2 статті 71 Кодексу адміністративного судочинства України. Такий спір може, зокрема, стосуватися оскарження податкового повідомлення-рішення, яким донараховано суму до сплати у зв'язку з застосуванням правил трансфертного ціноутворення. Тоді недоведеність факту пов'язаності осіб призведе до того, що операції між ними не вважатимуться контрольованими та ціна за таку операцію не підлягатиме коригуванню за методами трансфертного ціноутворення.​