Суму недоїмки, штрафу та пені без винесення податкового повідомлення-рішення і лише на підставі акту перевірки стягнути неможливо. Саме податкове повідомлення-рішення є тим індивідуальним актом правозастосування, на підставі якого може бути здійснено таке стягнення, проте висновки, викладені в акті перевірки в перспективі можуть за собою тягнути інші негативні наслідки для платника податків та його контрагентів.
Такими наслідками, зокрема, можуть бути відкриття кримінального провадження проти платника податків, проведення перевірок контрагентів платника податків.
Одним з механізмів захисту порушених прав платника податків у цьому випадку може стати оскарження дій (бездіяльності) конкретної посадової особи податкового органу в суді.